據統計，鼻咽癌的在人群中的發病率已經達到了一個很恐怖的數字，很多的醫學家都在研究鼻咽癌的原因，至今很多的醫學家都還沒有發現他的病因，他們認為可能是由於遺傳、病毒、以及環境因素引起的。
㈠遺傳因素：鼻咽癌的發病有明顯的地區性，有明顯的種族和家族聚集性。鼻咽癌好發於黃種人，很少見白種人患有此病。鼻咽癌發病高的家族如遷居海外，其後裔仍保持高發病率的傾向。鼻咽癌病人常有明顯家族史。這些現象說明遺傳背景在本病發生中起著一定的作用。
㈡病毒因素：我國90%以上的人在年幼時都已感染過EB病毒，EB病毒的感染是十分普遍的。而鼻咽癌的發生具有明顯的地區性，因此不能認為EB病毒的感染就是鼻咽癌的原因。但是在大量研究中又發現EB病毒與鼻咽癌的關系十分密切。
㈢環境因素：高發區居民嗜食當地的鹹魚、腌肉、腌菜，在這些食品中亞硝酸鹽的含量特高並含有一定量的亞硝胺及其多種化合物。其中的二亞硝基哌嗪(DNP)已被證實可誘發小鼠鼻咽粘膜上皮不典型增生、原位癌、浸潤癌，誘發率高達40%。說明亞硝胺及其化合物與鼻咽癌的原因因素關系密切。