鼻內鏡鼻窦手術將傳統的破壞性手術，變為根據病變的程度，在徹底清除病變的基礎上，盡可能保留鼻腔、鼻窦的正常黏膜和結構，形成良好的通氣和引流通道，促使鼻腔、鼻窦黏膜的形態和生理功能恢復的功能性手術，以達到依靠鼻腔、鼻窦自身生理功能的恢復治愈鼻窦炎和鼻息肉，並防止復發的目的。該手術的發展和CT掃描技術的進步，使鼻腔、鼻窦病變的治療發生了根本性的變化。傳統的鼻窦黏膜根治術已漸被保存黏膜的鼻窦口切開引流術所代替，功能性內鏡鼻窦手術目前已成為治療鼻腔、鼻窦疾病的主流。
那麼哪些疾病適合於在鼻內鏡下手術治療呢？ 慢性鼻窦炎、肥厚性鼻炎、鼻息肉、鼻霉菌病、鼻窦囊腫、鼻中隔偏曲、部分鼻腫瘤等均為鼻部的常見病、多發病。由於這些疾病具有易復發、難治愈等特點，給患者朋友們帶來了不少痛苦。這些疾病是鼻內鏡手術治療的主要適應症，由於鼻內鏡手術的具有准確、微創等優勢，使得上述疾病的的治愈率得到了顯著提高，病人手術的痛苦也有減少。
另外，隨著近年來鼻內鏡技術的飛速發展，鼻內鏡手術的適應症也向鼻眼相關疾病、顱底疾病延伸，使得相關疾病的傳統手術向微創手術發展。如慢性淚囊炎、視神經損傷引起的失明、垂體瘤等也可在鼻內鏡下手術，既避免了鼻外切口遺留下來的鼻面部疤痕，又減少了手術的創傷。