鼻窦炎常在急性鼻炎後引起，所以預防鼻窦炎，首先要預防鼻炎發生。預防的方法兩者相似。
預防鼻窦炎要做到飲食起居有定時，戒除煙酒嗜好，注意口腔清潔，鍛煉體質，用冷水擦浴，勿穿濕衣裳、鞋襪，因背冷腳凍，易引起傷風感冒。經常打掃庭園，居室要通風良好，陽光充足。注意保護鼻粘膜，居室要保持一定濕度，干燥空氣常影響鼻粘膜生理功能，鼻粘膜干燥，纖毛活動停止，易使病毒、細菌侵襲致病。此外鼻腔內不隨意滴藥，因很多藥水與鼻粘膜的酸鹼度不相符合，滴藥會影響鼻生理功能，太熱、太冷、干燥都是對鼻粘膜不利的。
預防鼻窦炎還應清除鄰近感染病變，例如慢性扁桃體炎、增殖體炎、慢性咽喉炎、蛀牙、牙槽流膿、口腔潰瘍等。這些病變應積極治療或手術清除。對於鼻腔本身病變，要及時治療，例如鼻中隔偏曲，經常妨礙鼻窦通氣和引流，應及早手術矯治。各種鼻炎、鼻息肉、腫瘤等常為鼻窦炎的誘因，應及時治好。過敏性鼻炎患者鼻粘膜水腫，影響鼻窦開口通氣引流，應作抗過敏治療。
游泳時要注意鼻窦進水感染，所以凡頭部入水前應先深吸氣，入水後用鼻呼氣，以抵住水入鼻內。凡頭部不浸水游泳，均應用口吸氣，用鼻呼氣。出水以後，如果鼻內有水，不宜用力擤出，可在地上作跳躍運動，同時用鼻作短促呼氣，以便將水噴出，或將水向後吸入再吐出。
飛機升降時，氣壓變化易致鼻窦炎，若有急性鼻炎者應禁止乘飛機。如非乘不可，應先用血管收縮劑滴鼻，使窦口通暢。
