1．全身症狀與急性鼻窦炎相比，慢性鼻窦炎的症狀較輕緩或不明顯。一般可有頭昏、易倦、精神抑郁、萎靡不振、納差、失眠、記憶力減退、注意力不集中、工作效率降低等症狀。極少數病例若已成為病灶者，可有持續低熱。
2.局部症狀主要有鼻部症狀，局部疼痛、頭痛及其他症狀。
(1)鼻部症狀：包括流膿涕、鼻塞及嗅覺障礙等症狀，慢性者極少發生鼻出血。
1)流膿涕：為主要症狀之一，其量多少不定，色黃或灰綠。若膿涕有腐臭氣味，多為牙源性上領窦炎。前組鼻窦炎的膿涕，易從前鼻孔溢出；後組鼻窦炎的膿涕，易經後鼻孔流向鼻咽部，須用力向後抽吸方可經口咳出或咽入胃內；凡偏頭或低頭時膿涕的量增加者，多為上颌窦炎；若晨起活動後膿涕略增，須考慮額窦炎或篩窦炎；若膿涕積留於下咽部的梨狀窩，則病人可有咽異物感。因膿涕經常流入鼻腔，可有慢性鼻炎症狀或導致急性鼻炎發作。
2)鼻塞：為慢性鼻窦炎的另一主要症狀。鼻甲粘膜腫脹或已發生息肉樣變，鼻息肉形成，膿涕過多或過稠等，均可成為鼻塞原因。若因膿涕的量特別多而致鼻塞，須將其摸出後方得以暫時通氣，則多見於上颌窦炎。
3)嗅覺障礙：表現為嗅覺減遲、失嗅或惡嗅覺。多為暫時性症狀，若鼻部病變經久不愈，嗅區粘膜可發生退行性變，故少數亦可呈永久性失嗅。嗅覺障礙的主要原因有嗅區粘膜炎性病變，包括粘膜腫脹、息肉樣變，或息肉形成；膿涕潴留阻塞嗅裂等。慢性篩窦炎者，嗅區粘膜受累多較嚴重。
(2)頭痛及其他：若慢性鼻窦炎有急性發作時，頭痛則較明顯。一般情況下則並無頭痛或不如急性者顯著。常表現為頭部沉重壓迫感，或僅有鈍痛或悶脹痛。其發作規律多為上午發生或較重，午後漸輕或消失，或為白天重夜晚輕。頭痛有較固定的部位，且多為一側；縱有雙側頭痛，必以一側為重。前組鼻窦炎，多為前額和鼻根部悶脹痛；後組鼻窦炎，則在額、枕部或頭頂部，有時可發生頸項及肩部肌肉疼痛或壓痛。牙源性上領窦炎，多伴同側上列牙痛；慢性額窦炎引流不暢時可有輕度頭痛，且以中午前後較為明顯。篩窦或蝶窦的慢性炎症有時可引起視力障礙，但少見。慢性鼻窦炎的頭痛亦可象急性者那樣：因低頭、咳嗽、屏氣或用力等使頭部靜脈壓增高時，或吸煙、飲酒及情緒激動時頭痛出現或加重；反之，或當休息、用藥、或以物理治療等方法使鼻腔通氣引流改善時則頭痛減輕或消失。