手術適應症是類固醇藥物治療無效的患者；合並多發性和/或復發性鼻窦炎的患者；鼻息肉手術後廣泛復發的患者。合並慢性鼻窦炎宜早期施行鼻息肉切除術以阻止息肉復發。凡有解剖變異者，應作相應的矯治，否則，即使有極輕微的急性發作也可導致頭痛或嚴重的感染。手術即要求盡量保留正常或可恢復的粘膜。功能性內鏡鼻窦手術為盡可能徹底切除鼻息肉和息肉樣變的粘膜、重建鼻窦的引流和矯正鼻腔的解剖異常提供了較傳統手術更為優越的條件。傳統的鼻息肉手術是在額鏡照明下，用圈套器或息肉鉗撕脫摘除的，缺點顯而易見，由於不能明視，手術中難免損傷息肉周圍的正常組織（如篩骨垂直板，篩骨紙樣板，中鼻甲等），而且不宜將息肉切淨，出血多，手術後容易復發。
內鏡的應用具有下列優點：
①提高診斷的精確性，可以在內鏡下觀察鼻息肉的起源部位，如鉤突、篩泡、上颌窦自然開口等；
②在明視下手術，有利於徹底清除鼻息肉，減少或避免對正常組織的損傷；
③良好的手術後護理。