外科治療的方法有下面三種情況：
1、解剖畸形的矯正能加重血管運動性鼻炎症狀的鼻內結構畸形主要是鼻中隔偏曲，重者常與鼻甲接觸甚至抵壓之。這樣長久形成的刺激不僅可加重局部炎症反應，而且常常引起頭痛。鼻內孔狹小也是一種常見的解剖畸形，主要引起鼻塞。鼻內孔狹小常由鼻外側軟骨下塌引起。由鼻內解剖畸形引起的鼻部症狀，有人稱之為結構性鼻炎。上述畸形早期矯正可明顯減輕症狀，甚至可以治愈。
2、不可逆變組織的切除明顯引起鼻塞的增生肥厚鼻甲，鼻粘膜長期水腫形成的鼻息肉，均應及時切除。
3、降低鼻內神經興奮性切斷副交感神經纖維對鼻腔的支配，以降低其興奮性。這類手術有：
（1）巖淺大神經切斷術，但因手術需要開顱實施，一般患者不易接受。
（2）翼管神經切斷術翼管神經內含進入鼻腔的副交感神經纖維。此法適用於兼患鼻息肉的患者。
這裡所說的外科方法也就是外科手術治療方法。這種方法是在病情惡化的情況下，會采用，也就是在經保守治療1年以上症狀不能控制且有加重趨勢；鼻內結構解剖畸形明顯影響通氣或鼻窦引流；不可逆病變組織如鼻粘膜增殖性改變或較大息肉這三種情況下，可考慮外科治療。
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